O PPEB, subunidade do NEB – Núcleo de Estudos Transdisciplinares em Educação Básica, está localizado em prédio próprio no Campus da UFPA no setor Profissional. Sua infraestrutura conta com:

• Salas de aula: possui   duas salas de aula próprias, equipadas com cadeiras (média de 30), mesa, armários, centrais de ar, quadro magnético, tela de projeção, caixa de som e projetor). Além desta, sempre que necessário o Programa utiliza outras salas de aula disponíveis no Núcleo, a fim de garantir a realização das atividades e de forma a acomodar as demandas de docentes e discentes.
• Sala de defesa:  uma sala destinada prioritariamente para a realização de exames de qualificação e defesa, assim como reuniões. A sala é equipada com cadeiras, mesas, quadro magnético, datashow, ar-condicionado e TV de 55’ com câmera de vídeo, caixa de som, microfone e todo o aparato para realizar videoconferência em tempo real. A sala também é utilizada para reunião de grupos de pesquisa e realização de outras atividades curricula
• Sala de estudos: Os discentes têm a sua disposição uma sala de estudos climatizada, equipada com mesas individuais, mesa de reunião, cadeiras e acesso à internet (via cabo ou wireless).
• Acesso à internet: possui e disponibiliza, sinal wi fi, para que os discentes do Programa possam acessar os recursos de informática nas salas de aula e na sala dos discentes da Pós-Graduação, todos com acesso ao Portal de Periódicos Capes.  O Programa dispõe de equipamentos de informática ligados à área acadêmica e administrativa e todos disponíveis e ligados em rede, com acesso à intranet.
• Site: Possui uma página eletrônica, com conteúdo atualizado e abas de encaminhamento para a consulta de informações gerais do curso, produtos educacionais, dissertações já defendidas, processos de seleção, comunicados, entre outros, funcionando funciona como importante canal de acesso e divulgação das atividades do PPEB. 
• Laboratórios e espaço dos grupos de pesquisa: o PPEB possui um laboratório de pesquisa à disposição dos discentes (para realização de atividades que contam com bolsistas de iniciação científica e/ou de extensão). É um espaço climatizado (duas centrais de ar), equipado com bancadas, cadeiras, mesa de reunião, 12 (doze) computadores conectados à internet, armários e um bebedouro. O espaço é de uso de discentes e bolsistas da graduação que estão vinculados aos projetos de pesquisas dos docentes. 
• Espaços multiusuários: uma copa, com mesa, fogão, geladeira, micro-ondas que pode ser acessado por servidores e discentes, a fim de garantir relativa comodidade àqueles que passam o dia na UFPA. A UFPA dispõe também de dois restaurantes universitários, com refeição ao custo de R$ 1,00 para discentes. Além disso, o Programa conta ainda com outros espaços como suporte de infraestrutura da universidade: 35 auditórios e 16 miniauditórios, com diferentes capacidades, disponíveis na Cidade Universitária da UFPA, equipados com som, projetor multimídia, telão e computador. 
• Biblioteca: O PPEB está vinculado ao Sistema de Bibliotecas da UFPA (SIBI/UFPA), composto por 36 bibliotecas universitárias e coordenado tecnicamente pela Biblioteca Central. Destacam-se as bibliotecas do Instituto de Ciências da Educação, especializada na área educacional, e a do Núcleo de Altos Estudos  Amazônicos, especializada em questões regionais. Ambas adotam o software Pergamum, e seus acervos estão integrados em um catálogo único, disponibilizado online. Oferecem à comunidade os mais diversos serviços de informação em suportes impressos e eletrônicos , permitindo a consulta e possibilitando o empréstimo e devolução de obras de seus acervos. 
  A Biblioteca Central da UFPA tem seu acervo formado por coleções que atendem o ensino em nível de graduação e às necessidades de estudo e pesquisa da comunidade em geral. As demais bibliotecas do Sistema têm seu acervo composto de modo a atender os cursos de graduação e pós-graduação na especialidade de acordo com a sua finalidade de atuação. Adota o software Pergamum para gerenciamento dos serviços técnicos e da rede de bibliotecas da UFPA. Disponibiliza acesso ao catálogo online do acervo das bibliotecas da UFPA, mantém a Estação de Pesquisas Acadêmicas (EPAC), com acesso gratuito à internet e um espaço próprio para o Portal de Periódicos da CAPES; participa da Comissão Brasileira de Bibliotecas Universitárias – CBBU, dos serviços cooperativos da BIREME (LILACS, Scad, BVs), IBICT (COMUT, BDTD, CCN, Repositorio Institucional), REBAP (Rede Brasileira de Bibliotecas da Área de Psicologia), Rede da BVS Enfermagem, FBN (Consórcio Eletrônico de Bibliotecas da Fundação Biblioteca Nacional), Plano Nacional de Obras Raras da Biblioteca Nacional, IBGE – Biblioteca Depositária do IBGE e é help desk do Portal de Periódicos da CAPES desde 2010.
  Além dos acervos das bibliotecas, o PPEB possui uma acervo próprio, organizado em estantes na sala do grupo de pesquisa, boa parte oriundo de doações, que fica à disposição dos discentes para empréstimo. 
• Sala para Coordenação do Programa e secretaria acadêmica: responsável pelo atendimento à Pós-Graduação, a coordenação dispõe de dois computadores para o uso pedagógico-adiministrativo, e dois para uso da secretaria. Todos conectados à internet e às impressoras (uma para a coordenação e uma para a secretaria do Programa).  O Programa ainda possui dois notebooks e dois projetores para uso itinerante em outras salas ou eventos. A sala da coordenação é climatizada e composta por mesas, cadeiras, armários verticais e gaveteiros. A secretaria  é unificada e nela funciona a secretaria dos dois programas do NEB. No conjunto, a secretaria possui uma bancada, quatro mesas individuais (duas para cada programa), cadeiras e 4 computadores de mesa  conectados à internet, sendo um específico para o PPEB. A secretaria também dispõe de arquivos, armários verticais, gaveteiros, um frigobar e um bebedouro.
• Espaço próprio para docentes e para orientação de discentes: Os docentes do PPEB, que são vinculados ao NEB, possuem gabinetes compartilhados entre dois docentes. O espaço conta com mesas, cadeiras e armários e é climatizado e também é utilizado para a realização de orientação. Para os docentes do PPEB oriundos de outras unidades da UFPA há uma sala própria para realização de orientações. A sala, também climatizada, dispoõe de duas mesas, duas cadeiras e um gaveteiro. 
• Sala para Coordenação do Programa e secretaria acadêmica: responsável pelo atendimento à Pós-Graduação, a coordenação dispõe de dois computadores para o uso pedagógico-adiministrativo, e dois para uso da secretaria. Todos conectados à internet e às impressoras (uma para a coordenação e uma para a secretaria do Programa).  O Programa ainda possui dois notebooks e dois projetores para uso itinerante em outras salas ou eventos. A sala da coordenação é climatizada e composta por mesas, cadeiras, armários verticais e gaveteiros. A secretaria  é unificada e nela funciona a secretaria dos dois programas do NEB. No conjunto, a secretaria possui uma bancada, quatro mesas individuais (duas para cada programa), cadeiras e 4 computadores de mesa  conectados à internet, sendo um específico para o PPEB. A secretaria também dispõe de arquivos, armários verticais, gaveteiros, um frigobar e um bebedouro.
• Acessibilidade: o acesso ao prédio e às salas de aula, assim como ao banheiro possuem acessibilidade (rampas, corrimãos, alargamento de portas e sinalizações que permitem o acesso com autonomia e independência). Na UFPA todos os corredores de integração dos prédios possuem piso tátil e nos blocos de sala de aula há elevadores acessíveis